教育经济研究所是中国教育经济学科学研究与人才培养的重要基地，所依托的二级学科教育经济与管理为国家重点学科，另设有与北京市共建机构首都教育经济研究院,是北京市哲学社会科学重点研究基地。

北京师范大学是国内最早开展教育经济学教学与科研的学术机构，王善迈、靳希斌、曲恒昌等老一辈学者率先开设教育经济学课程，并培养教育经济学专业硕士、博士研究生。教育经济研究所承担了国家社科基金重大课题、教育部人文社会科学重大攻关项目、国家自然科学基金课题、全国教育科学规划重点项目、世界银行、亚洲开发银行、联合国儿童基金会、英国国际发展部等国际组织的课题几十项。在教育财政、教育与经济发展、学校管理经济学、教育政策的经济分析、教育项目的监测与评价等领域已经取得丰硕的研究成果，为教育部、财政部、国际组织等提供大量的有重要价值的咨询报告。获得国家图书奖、全国教育科学优秀成果一等奖、北京市哲学社会科学一等奖等各类省部级以上奖项二十余项。教育经济研究所秉承北京师范大学教育经济研究重视理论，关注现实，突出方法的优良传统，以追求卓越，创新知识，服务社会为宗旨。开拓创新、锐意进取，力争在人才培养、科学研究与社会服务等方面做出更为优异的成绩。